SMP Negeri 3 Bantul berdiri sejak tanggal 13 Juni 1985 dengan SK Pendirian Sekolah : 0594/1985. Namun sekolah ini baru mendapatkan SK Izin operasional pada tanggal 22 November 1985. Nomor Pokok Sekolah Nasional (NPSN) : 20400330. Sekolah ini berada di Jalan Sultan Agung, Peni, Palbapang, Bantul, Bantul, Yogyakarta.Sekolah ini menempati lahar seluas : 7.135 M2. Saat ini ada 21 rombongan belajar (rombel) di SMPN 3 Bantul. dengan jumlah peserta didik sebanyak : 348 (pa 341 dan pi 307). Untuk jumlah guru ada 44 dan menggunakan kurikulum merdeka untuk kelas 7 sedangkan kelas 8 dan 9 menggunakan kurikulum merdeka. Namun mulai tahun ajaran 2023-2024, peserta didik kelas 8 juga akan mengikuti KBM dengan kurikulum merdeka.
